自然杂志教你如何用软件管理参考文献

有了数字参考办理对象，被安葬的学问和被觉察之间惟有一个关键词搜查的间隔。

AdamRocker并未渴想办理其数字参考典籍馆的软件能提议开展研讨的更好办法。不过，他的电子文件归档系统ReadCube会按时扫描典籍馆，并举荐一些相干论文。这和一些音乐文件办理程序会强调所举荐的曲目很是宛如。Rocker说，这一功效带来了一些出乎意外的成就。

Rocker是一名研讨生，现在在加拿大渥太华大学进修医学。他曾研讨过斑马鱼的细菌传染。那时，ReadCube举荐了一篇操纵微流体诱捕斑马鱼的论文。这比他本身的办法要浅显良多，但Rocker每每不会抚玩微流体范畴的文件。他说，被揭示留心到这项研讨“果真很有扶助”，纵然终究因过度寄期望于本身的项目而未采纳这类取代办法。

正如Rocker所觉察的，这日的文件办理对象曾经超出浅显的电子归档。当前，每个对象经过供给一系列一直演进的额外功效吸引着顾主，就像瑞士军刀相同。

日前，《果然》杂志聚焦了8种对象：Colwiz、EndNote、FWorkspace、Mendeley、Papers、ReadCube、RefME和Zotero。它们均参加了文件办理商场的比赛，一些在简化抚玩历程和设立文件典籍馆方面展现非凡，而其余对象埋头于缔造文件目录，经过同享处事空间的操纵贴补配合，大概举荐论文。

“顺从”文件

每种对象的存在都是为了扶助研讨人员“顺从”被下载得杂七杂八且分开的PDF。大普遍科学家会波及这个题目：在他们从期刊网站——每每指定难懂的字母数字代码为文件名——抓取到PDF并将其洪量转储就任何便利的文件夹中时，跟着文件的多个拷贝遍及硬盘，混乱便会很快呈现。

“在科学界，大概起码从我的阅历来讲，咱们常常终究在桌面上会有云云一个文件夹：它的内部充满着个名字果真很诡异的PDF文档。”西班牙巴塞罗那Bellvitge生物医学研讨所神经学家RaúlDelgado-Morales示意。

文件办理对象经过为硬盘设立索引治理了这一搅扰。每每，将一个PDF拖动并放入运用窗口的历程，会触发软件试验操纵数字目标仅有标帜符（DOI）或题目对其停止识别，而且从在线效劳器上检索相干元数据，比方题目、关键词或做家名字。

研讨人员还可指使软件监控寄放文档的特定文件夹。随后，他们能经过浅显地搜查做家名字、关键词，或在一些状况下搜查本身的标注寻觅PDF。比方，Delgado-Morales操纵Papers机关他的文件典籍馆治理了这一题目。Papers是一款凭借用户取舍的任何企图积极从头定名文档的运用程序。其余对象也供给近似功效，除了RefME。RefME是一款网站和手机运用程序，仅积聚参考材料列表而非PDF本身。

中央功效

大普遍对象能扶助研讨人员输入来自多种在线资本的文件。良多供给在运用程序内搜查诸如PubMed和google学术等外部数据库，以及能从期刊网站和其余网页上抓取文件数据的抚玩器插件。

美国弗吉尼亚州乔治梅森大学Zotero项目负责人SeanTakats引见说，创立于10年前的Zotero是一个免费的开源软件项目，特地用于治理从网页抚玩器中提守音信的题目。“这是Zotero的关键功效，而且是同其余文件办理对象比拟最雄壮的功效之一。”RefME则操纵智妙手机的相机扫描条形码，供给不同平常的参考文件选项。

参考文件办理软件最驰名的功效之一是在一篇研讨论文中插入文内引用，并以任何形态缔造文件目录。被精深操纵的贸易软件包EndNote供给这一功效已稀有十年，但现在面对着来自良多当代对象的比赛。

良多对象能同罕见的文字治理软件交互，因而输入一篇研讨文章的用户只要取舍他们想说起的论文而后点击按钮让代码插入文档中，便可记号文本内引用。随后，用户能凭借上千种期刊的风致，从下拉清单当选当选项，缔造文件目录和文内引用。

大普遍对象包含用于抚玩并为文章做表明的内置PDF抚玩器——每每容许用户搜查谈论和表明，以及基于云霄的在iPad和台式电脑之间同步这些谈论和PDF的才能。比方，在ReadCube中，PDF里的文中引用和做家名字能浮现为积极超链，供给直接获得被引用文章和发布目录的道路。当在配合出书商的网站上观察并为PDF做解释时，相同的功效也是可用的。

在这些对象中，良多能识别同典籍馆中特定条件相干的文章，大概基于典籍馆整个体例举荐文章。和ReadCube近似，FWorkspace操纵一种算法结尾此项功效。它还会操纵约位大师所做的举荐。不过，良多单机软件产物也能举荐论文。

同享典籍馆

现在，良多对象容许研讨人员配置群组典籍馆，或同长途配合者同享紧急论文，纵然这一历程被留心办理着，以防袭击出书商的版权。比方，Mendeley大众群组中的人仅能同享对于一篇论文的音信，这相当于典籍馆目录的一个进口。惟有个人群组中的用户能同享并改动PDF，而群组必需进级到一个付费账户，才华增加超出3个体。

明尼苏达大学机关心思学博士生BrentonWiernik操纵Zotero的同享典籍馆结尾波及该范畴华文件系统性回头和元解析的配合项目。他引见说，此类处事大概牵涉到15～20人：一些人把文章下载到同享典籍馆中；其余人抚玩它们；果然，更多人负责增加解释和标签，而且纪录关键数据。

凭借Wiernik的引见，这一历程和操纵同享的云储备文件夹近似，而额外的益处是Zotero能追踪并保管元数据、条记和解释。比方，研讨人员可操纵专用记号教导他们正在治理一篇文章，以此告知配合者理应治理不同文章，以防止反复处事。

FWorkspace和colwiz均能将同享功效扩大到打算底稿和办理项目上。FWorkspace公司产物研发司理JoaoPeres引见说，经过该对象，研讨人员能操纵插件将微软Word底稿上传到一个平安场所，进而使团队成员对同享的拷贝停止谈论，纵然文本无奈在抚玩器中被编纂。Peres企图实即将论文直接从FWorkspace发送给期刊编纂的“一键”文章提交功效，而这会从FResearch期刊最先。colwiz还容许用户将文件同享到一个在线启动器，以供团队成员观察和谈论。

思量到这些对象高度叠加的功效，用户的取舍每每归纳于特定的个体偏好。比方，加州桑迪亚国度测验室材料学家RichardKarnesky因开源精力而赞成Zotero。

大概，操纵文件办理对象的最佳出处在于此项技艺能供给一种可搜查影象的形态。礼来公司资深研讨科学家BoydSteere示意，设想一张堆满了打印出来的论文的桌子。而当前，充满着PDF的电子文件夹在良多方面相同推绝易操控。不过，有了数字参考办理对象，被安葬的学问和被觉察之间惟有一个关键词搜查的间隔。

（来历：华夏科学报）

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