鹿明生物避坑攻略蛋白质组学代谢组学样本

编者按：

一个好的科学研究前提是什么？科学问题？实验设计？勤劳的双手？这些都是前提。但是，还有一样东西是决定研究成败的关键，那就是实验样本。如果想要得到一个好的实验结果，样本的采集和预处理进行严格的把控必不可少~

今天小鹿跟大家来聊一聊常规组学样本的收集与保存避坑攻略，总结归纳为以下“一要求七要素”，轻轻松松就能完成样本的收集：

一要求

减少人为的污染，降解和修饰。

七要素

一致：实验组与对照组取样一致性，如组织样本组织块的大小、取样部位，血液样本性别年龄的匹配，尿液样本取样时间等；

除杂：去除与实验无关的杂质，如动物组织去血、植物组织去除泥土等污染物、菌体及细胞去除培养基等，推荐使用PBS缓冲液或者生理盐水，吸水纸吸干残留液体；

低温：样本预处理尽量低温，可以在冰上进行杂质去除和分装的操作，低温保存，通常保存在-80℃冰箱；

分装：根据实验用量进行分装，避免反复冻融；

迅速：样本收集，制备，存储和运输应尽可能的迅速，压缩样本采集到正式实验的时间；

标记：用优质的记号笔清晰的标记好样品名称，以免混淆样本；

包装：建议使用进口的离心管、冻存管收集样本，以防在运输和操作过程中样本管破裂以及聚合物对样本造成污染，植物样本可以用锡箔纸包装，锡箔纸外面套一个自封袋以免运输过程中样本洒落。

下面小鹿就以蛋白组学和代谢组学的组织样本为例，看看“一要求七要素”在具体样本取样中的应用细节~

代谢组学组织样本

收集注意事项

动物组织（包括脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉和皮肤等；软体动物如血吸虫）：

1）取适量组织器官，用预冷的PBS缓冲液或生理盐水清洗干净；

2）迅速剥去非必需的脂肪和结缔组织，再用PBS缓冲液或生理盐水冲洗干净；

3）用干净的无尘吸水纸吸干水分，将组织分成50-mg/管分装待用；

4）管子上做好标记后速冻处理，-80℃冻存；干冰运输。

温馨提示：

1.对于动物组织样本无法满足50mg/样，如海马组织，大脑组织等，可考虑同组混样以达到50mg/样的要求。

2.尽量不要使用锡箔纸以及自封袋包装样本，建议将样本液氮研磨后使用离心管/冻存管进行分装。

3.在使用PBS缓冲液/超纯水进行漂洗时，需要尽快处理。

蛋白组学组织样本

收集注意事项

//常规组织//

PBS洗涤去除残留血液和污染物，剔除无关的干扰组织（血管、脂肪、结缔组织等）；

冲洗干净，用组织剪或手术刀将组织分离成1cm左右的小块；

液氮速冻5min，保存于-80℃，干冰运输。

——心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、肌肉等样本

注意：

1）对于人体手术切除的组织，最好用PBS（磷酸缓冲盐溶液，作为溶剂，起溶解保护试剂的作用）取完之后直接去血。

2）对于小鼠、大鼠、兔子之类的组织样品，建议用灌流的方式来去血，尤其是像肝脏、胃、心脏这类大的组织，可以直接用灌流的方式去血，去得最干净。其次的方案是在后期剪碎的时候去血。

3）对于组织重量远低于mg的样本，如斑马鱼大脑组织、小鼠海马组织等，可考虑混样。

//软骨组织//

尽量选择大小相近的样品，将样品表面清洗干净，清除泥沙，将样品存放于离心管，较大的样品用手术刀将软骨切成1cm左右的小块；

液氮速冻5min，保存于-80℃，干冰寄送。

//软体动物//

尽量选择大小相近的样品，将样品表面清洗干净，清除泥沙，将样品存放于离心管，较大的样品可剪成小块后存放；

液氮速冻5min，保存于-80℃，干冰寄送。

——软体动物贝壳等

//动物毛发//

用适量2%SDS，50mM磷酸钠（pH7.8）缓冲液漂洗样品或用PBS进行清洗，去除污染物，干燥；

液氮速冻5min，保存于-80℃，干冰寄送。

样本量要求

蛋白组学

常规动物组织（心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、肌肉等）-定量蛋白组学mg；修饰蛋白组学mg

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