时空组专辑数据库文献详解ZESTA斑
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深圳华大生命科学研究院联合华中农业大学等团队,利用华大自主研发的Stereo-seq时空组学技术,结合多切片策略,在单细胞分辨率水平上,对斑马鱼受精后24h(hpf,hourpost-fertilization)以内6个关键时间点(3.3、5.25、10、12、18、24hpf)的胚胎进行研究。研究人员首次绘制了斑马鱼胚胎早期发育的时空转录组图谱,构建了在组织空间维度上的发育轨迹。此研究能够直观地观察到,在原位组织上细胞是如何分化、迁移并发育形成各组织器官的。该文章于年5月4日发表在DevelopmentalCell。
研究人员还构建了一个高质量的斑马鱼胚胎发生时空转录组图谱(zebrafifishembryogenesisspatiotemporaltranscriptomicatlas,ZESTA)。
#ZESTA
ZESTA利用Stereo-seq技术分析了斑马鱼胚胎发育过程中基因表达和调控网络的时空动态。用户可通过数据库主页面或导航栏,快速获取研究内容梗概、时空和单细胞转录组聚类分析结果、空间分辨发展轨迹、研究技术(Stereo-seq)简介、研究中使用分析软件及产生的数据资源信息,同时还能直接下载研究数据。
期刊:DevelopmentalCell
数据编号:CNP
数据库:
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