单细胞测序文献解读拟南芥根系单细胞测序

单细胞转录组测序作为区别于传统Bulk-RNA测序的新兴技术,更好的解决了传统研究中存在的细胞异质性问题,为细胞类型鉴定及新细胞类型发现、细胞发育轨迹和功能分析等提供了良好的解决方案,已广泛应用于人类和动物研究。目前植物方面应用范围也在逐步扩大,今天本文就带大家一起看一下年2月7日发表在DevelopmentalCell上的关于拟南芥根系单细胞图谱的文章。

研究背景

在多细胞生物中,转录调控网络精细控制着细胞命运以及器官的发育和成熟。想对此进行全面的研究,需要详细的时空基因表达模式的知识。相对于斑马鱼等动物模型,拟南芥根系基于其简单的结构和无限生长特性,是研究发育轨迹背后时空转录特征的理想模型。然而尽管之前已有部分关于拟南芥根系的单细胞研究,建立了根系单细胞的测序的基本原理并成功捕获到了根系的所有主要细胞类型,目前仍没有超过个细胞的根系单细胞图谱测序,只有一个研究推断了三种以上细胞类型的发育进展。此外,每个图谱都只

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